Rencontres R 2024 - Sciencesconf.org

9:00 - 9:40 (40min)

Conférence plénière de Nicolas Raillard

A250

Audrey Poterie

› R POUR L'OCÉANO-MÉTÉO ET L'INGÉNIERIE MARINE - Nicolas Raillard, LHYMAR 09:00-09:40 (40min)

9:40 - 10:20 (40min)

Dataviz

A250

Julie Lenoir

› telraamStats : visualisation des mobilités pour la recherche et les citoyen·ne·s - Ketsia Guichard-Sustowski, Institut de Recherche Mathématique de Rennes, Centre de recherche en économie et management 09:40-10:00 (20min)

› Collecter et cartographier les données du bilan carbone d'un congrès - Chloé Friguet, Université Bretagne Sud / IRISA et François Husson, Laboratoire de Mathématiques Appliquées - Agrocampus Rennes 10:00-10:20 (20min)

10:20 - 10:50 (30min)

Pause café

Hall principal

10:50 - 12:10 (1h20)

Méthode statistique

A250

Vincent Brault

› Estimation de quantiles conditionnels extrêmes : Package Extremefit - Gilles Durrieu, Laboratoire de Mathématiques de Bretagne Atlantique 10:50-11:10 (20min)

› Clustering sur données incomplètes avec clusterMI - Vincent Audigier, Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] : EA4629 11:10-11:30 (20min)

› Créer son propre package d'extension {recipes}: retour d'expérience de {scimo} - Antoine Bichat, Les Laboratoires Servier 11:30-11:50 (20min)

› Smooth testing and clustering of copulas - Yves Ismaël NGOUNOU BAKAM, CREST-ENSAI 11:50-12:10 (20min)

12:10 - 13:30 (1h20)

Déjeuner

Hall principal

13:30 - 14:10 (40min)

Conférence plénière d'Elise Maigné

A250

Paul Bastide

› SK8 : Pour des applications shiny qui se déploient comment sur des roulettes - Elise Maigné, MIA-T 13:30-14:10 (40min)

14:10 - 14:40 (30min)

Courte 2

A250

François Husson

› Explorer et comparer des cartes de zones climatiques locales avec le paquet lczexplore - Matthieu Gousseff, Equipe DECIDE 14:10-14:16 (06min)

› Des applications Shiny qui facilitent la vie - Terence Dechaux, Institut de l'élevage 14:16-14:22 (06min)

› Application Shiny XPBlocs - Création de blocs en expérimentation - Maxime Legris, Institut de l'Elevage 14:22-14:28 (06min)

› Utilisation du package {flexdashboard} pour le contrôle des données de biologie dans un entrepôt de données de santé - Morgane Pierre-Jean, Univ Rennes, CHU Rennes, INSERM, LTSI-UM R 1099 14:28-14:34 (06min)

› easy16S : une application Shiny pour explorer ses données métagénomiques - Cédric Midoux, Université Paris-Saclay, INRAE, PROSE, 92160, Antony, France, Université Paris-Saclay, INRAE, MaIAGE, 78350, Jouy-en-Josas, France, Université Paris-Saclay, INRAE, BioinfOmics, MIGALE bioinformatics facility, 78350, Jouy-en-Josas, France 14:34-14:40 (06min)

14:50 - 15:50 (1h)

Statistique pour l'environnement

A250

Baptiste Alglave

› Human in the deep: Converting research activities pressures into ecological impact assessment. - Riwan Leroux, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer 14:50-15:10 (20min)

› Maturation de codes scientifiques R de traitement de données liées à l'Eau au BRGM (initiative MATUREAU) - Marc Laurencelle, Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) 15:10-15:30 (20min)

› Un suivi régionalisé et actualisé des étiages des petits cours d'eau, c'est possible avec R, Hub'Eau et GitHub ! - Pascal Irz, Direction régionale Bretagne 15:30-15:50 (20min)

15:50 - 16:20 (30min)

Pause café

Hall principal

16:20 - 17:20 (1h)

Gestion de projet R, bonnes pratiques

A250

Pierre Gloaguen

› Sécurisation des analyses statistiques avec R : retour d'expérience - Aurore Philibert, Pôle Biostatistique - Julien Dugas, Pôle Biostatistique 16:20-16:40 (20min)

› Refactoring : du code qui marche, c'est bien, mais du code maintenable, c'est mieux - Vincent Guyader, ThinkR 16:40-17:00 (20min)

› Une vie polyamoureuse entre R et Julia - Remy Drouilhet, Laboratoire Jean Kuntzmann 17:00-17:20 (20min)

16:20 - 17:20 (1h)

Aide à la vie de tous les jours et à l'enseignement

A101

Audrey Lavenu

› Un petit coup de polish - Nettoyage de fichiers Excel avec R - Thomas Vroylandt, Kantiles 16:20-16:40 (20min)

› {saperlipopette}, un paquet R pour progresser en Git en toute sérénité - Maëlle SALMON, rOpenSci, cynkra 16:40-17:00 (20min)

› Génération aléatoire d'exercices de biostatistiques pour Moodle via le package SARP.Moodle de R - Emmanuel Curis, UR 7537 BioSTM, Faculté de pharmacie de Paris, Service d'Hématologie Biologique [CHU Lariboisière] 17:00-17:20 (20min)

18:30 - 23:55 (5h25)

Diner de gala

Attention, si vous arrivez trop tard, le bateau partira sans vous.

	Mer. 12	Jeu. 13	Ven. 14
09:00 10:00 11:00 12:00 13:00 14:00 15:00 16:00 17:00 18:00 19:00 20:00 21:00 22:00 23:00	Accueil des participants et pause café 9:00 - 10:00 (1h) Accueil des participants et pause café Hall principal Tutoriel "Dérivation automatique et optimisation avec la libraire Torch" Tutoriel "Créez des environements reproductibles avec rix" 10:00 - 12:00 (2h) Tutoriel "Dérivation automatique et optimisation avec la libraire Torch" S211 › Dérivation automatique et optimisation avec la libraire torch - Tristan Mary-Huard, Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) 10:00-12:00 (2h) 10:00 - 12:00 (2h) Tutoriel "Créez des environements reproductibles avec rix" A101 Bruno André Rodrigues Coelho › Créez des environements reproductibles avec rix - Bruno André Rodrigues Coelho, Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche 10:00-12:00 (2h) Déjeuner 12:00 - 14:00 (2h) Déjeuner Hall principal Ouverture des rencontres R 2024 14:00 - 14:10 (10min) Ouverture des rencontres R 2024 A500 Chloé Friguet présidente du comité d'organisation des rencontres Conférence plénière de Cécile Proust-Lima 14:10 - 14:50 (40min) Conférence plénière de Cécile Proust-Lima A500 Solène Desmée › Modélisation conjointe de données longitudinales et de temps d'événements sous R - Cécile Proust-Lima, Bordeaux population health 14:10-14:50 (40min) Biostatistique 15:00 - 16:00 (1h) Biostatistique A500 Julie Aubert › Extending code from the saemix package to fit parametric joint models in R - Emmanuelle Comets, Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution, Institut de recherche en santé, environnement et travail 15:00-15:20 (20min) › Mise en oeuvre de méthodes semi-Bayésiennes de calcul des erreurs standards pour les données éparses dans le package saemix - Mélanie Guhl, Université Paris Cité, INSERM, IAME, UMR 1137 15:20-15:40 (20min) › BeQut, un package R pour l'estimation bayésienne de modèles de régression quantile à effets mixtes via JAGS - Antoine Barbieri, Univ. Bordeaux, Inserm BPH U1219, F-33000, Bordeaux 15:40-16:00 (20min) Pause café 16:00 - 16:30 (30min) Pause café Hall principal Reproductibilité 16:30 - 17:10 (40min) Reproductibilité A500 Aurélie Siberchicot › Garantir des analyses fiables avec les packages R : perspectives de la recherche clinique - Yann Féat, mainanalytics GmbH 16:30-16:50 (20min) › Créez des environements reproductibles avec rix - Bruno André Rodrigues Coelho, Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche 16:50-17:10 (20min) Courte 1 17:20 - 17:50 (30min) Courte 1 A500 Vincent Brault › Une enquête auprès des métiers de la « data » : quelle place pour R et ses utilisateurs ? - Antoine GIRARD, data analyst indépendant 17:24-17:30 (06min) › Pour un namespace tout en souplesse - Swann Floc'hlay, ThinkR 17:26-17:32 (06min) › ProteoBayes : un cadre bayésien pour l'analyse protéomique différentielle - Marie Chion, MRC Biostatistics Unit, University of Cambridge 17:32-17:38 (06min) › Cadre R chez IMPACT Initiatives - Yann Say, IMPACT Initiatives 17:38-17:44 (06min) › Comment les communautés autour de R peuvent changer vos pRojets - Marie Vaugoyeau, MStats 17:44-17:50 (06min) Poster et cocktail dinatoire 18:00 - 20:00 (2h) Poster et cocktail dinatoire Hall principal › hubeau: un package pour interroger les APIs du Système d'Information sur l'eau en France - Pascal Irz, Direction régionale Bretagne 18:00-20:00 (2h) › SK8 : Un service institutionnel de gestion et d'hébergement d'applications Shiny - jean-françois rey, Biostatistique et Processus Spatiaux - Élise Maigné, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse 18:00-20:00 (2h) › Créer un site pour partager sa recherche avec R, blogdown et Hugo - Fanny Ollivier, Laboratoire de Psychologie des Pays de la Loire 18:00-20:00 (2h) › Les packages autour de JDemetra+ (rjd3) : une boîte à outils complète pour l'analyse des séries temporelles - Tanguy BARTHELEMY, INSEE 18:00-20:00 (2h) › Poster autour du package {datamods} - Samra Goumri, dreamRs - Victor PERRIER, dreamRs 18:00-20:00 (2h) › Distance/Divergence entre distributions t multivariées - Pierre Santagostini, IRHS - Équipe ImHorPhen (Imagerie pour l'Horticulture et le Phénotypage) 18:00-20:00 (2h) › A survey translation tool to easily migrate from Qualtrics to LimeSurvey - Camille Straboni, Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris 18:00-20:00 (2h) › RecForest : Forêts aléatoires de survie pour l'analyse des événements récurrents en R - Juliette Murris, Health data- and model- driven Knowledge Acquisition 18:00-20:00 (2h) › Des tableaux et des graphiques prêts à publication avec les packages R {tabularise} et {chart} de la suite SciViews - Guyliann Engels, Service d'écologie numérique, Institut Complexys & Infortech, Université de Mons, Cellule de Pédagogie Facultaire des Sciences, Université de Mons 18:00-20:00 (2h)	Conférence plénière de Nicolas Raillard 9:00 - 9:40 (40min) Conférence plénière de Nicolas Raillard A250 Audrey Poterie › R POUR L'OCÉANO-MÉTÉO ET L'INGÉNIERIE MARINE - Nicolas Raillard, LHYMAR 09:00-09:40 (40min) Dataviz 9:40 - 10:20 (40min) Dataviz A250 Julie Lenoir › telraamStats : visualisation des mobilités pour la recherche et les citoyen·ne·s - Ketsia Guichard-Sustowski, Institut de Recherche Mathématique de Rennes, Centre de recherche en économie et management 09:40-10:00 (20min) › Collecter et cartographier les données du bilan carbone d'un congrès - Chloé Friguet, Université Bretagne Sud / IRISA et François Husson, Laboratoire de Mathématiques Appliquées - Agrocampus Rennes 10:00-10:20 (20min) Pause café 10:20 - 10:50 (30min) Pause café Hall principal Méthode statistique 10:50 - 12:10 (1h20) Méthode statistique A250 Vincent Brault › Estimation de quantiles conditionnels extrêmes : Package Extremefit - Gilles Durrieu, Laboratoire de Mathématiques de Bretagne Atlantique 10:50-11:10 (20min) › Clustering sur données incomplètes avec clusterMI - Vincent Audigier, Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] : EA4629 11:10-11:30 (20min) › Créer son propre package d'extension {recipes}: retour d'expérience de {scimo} - Antoine Bichat, Les Laboratoires Servier 11:30-11:50 (20min) › Smooth testing and clustering of copulas - Yves Ismaël NGOUNOU BAKAM, CREST-ENSAI 11:50-12:10 (20min) Déjeuner 12:10 - 13:30 (1h20) Déjeuner Hall principal Conférence plénière d'Elise Maigné 13:30 - 14:10 (40min) Conférence plénière d'Elise Maigné A250 Paul Bastide › SK8 : Pour des applications shiny qui se déploient comment sur des roulettes - Elise Maigné, MIA-T 13:30-14:10 (40min) Courte 2 14:10 - 14:40 (30min) Courte 2 A250 François Husson › Explorer et comparer des cartes de zones climatiques locales avec le paquet lczexplore - Matthieu Gousseff, Equipe DECIDE 14:10-14:16 (06min) › Des applications Shiny qui facilitent la vie - Terence Dechaux, Institut de l'élevage 14:16-14:22 (06min) › Application Shiny XPBlocs - Création de blocs en expérimentation - Maxime Legris, Institut de l'Elevage 14:22-14:28 (06min) › Utilisation du package {flexdashboard} pour le contrôle des données de biologie dans un entrepôt de données de santé - Morgane Pierre-Jean, Univ Rennes, CHU Rennes, INSERM, LTSI-UM R 1099 14:28-14:34 (06min) › easy16S : une application Shiny pour explorer ses données métagénomiques - Cédric Midoux, Université Paris-Saclay, INRAE, PROSE, 92160, Antony, France, Université Paris-Saclay, INRAE, MaIAGE, 78350, Jouy-en-Josas, France, Université Paris-Saclay, INRAE, BioinfOmics, MIGALE bioinformatics facility, 78350, Jouy-en-Josas, France 14:34-14:40 (06min) Statistique pour l'environnement 14:50 - 15:50 (1h) Statistique pour l'environnement A250 Baptiste Alglave › Human in the deep: Converting research activities pressures into ecological impact assessment. - Riwan Leroux, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer 14:50-15:10 (20min) › Maturation de codes scientifiques R de traitement de données liées à l'Eau au BRGM (initiative MATUREAU) - Marc Laurencelle, Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) 15:10-15:30 (20min) › Un suivi régionalisé et actualisé des étiages des petits cours d'eau, c'est possible avec R, Hub'Eau et GitHub ! - Pascal Irz, Direction régionale Bretagne 15:30-15:50 (20min) Pause café 15:50 - 16:20 (30min) Pause café Hall principal Gestion de projet R, bonnes pratiques Aide à la vie de tous les jours et à l'enseignement 16:20 - 17:20 (1h) Gestion de projet R, bonnes pratiques A250 Pierre Gloaguen › Sécurisation des analyses statistiques avec R : retour d'expérience - Aurore Philibert, Pôle Biostatistique - Julien Dugas, Pôle Biostatistique 16:20-16:40 (20min) › Refactoring : du code qui marche, c'est bien, mais du code maintenable, c'est mieux - Vincent Guyader, ThinkR 16:40-17:00 (20min) › Une vie polyamoureuse entre R et Julia - Remy Drouilhet, Laboratoire Jean Kuntzmann 17:00-17:20 (20min) 16:20 - 17:20 (1h) Aide à la vie de tous les jours et à l'enseignement A101 Audrey Lavenu › Un petit coup de polish - Nettoyage de fichiers Excel avec R - Thomas Vroylandt, Kantiles 16:20-16:40 (20min) › {saperlipopette}, un paquet R pour progresser en Git en toute sérénité - Maëlle SALMON, rOpenSci, cynkra 16:40-17:00 (20min) › Génération aléatoire d'exercices de biostatistiques pour Moodle via le package SARP.Moodle de R - Emmanuel Curis, UR 7537 BioSTM, Faculté de pharmacie de Paris, Service d'Hématologie Biologique [CHU Lariboisière] 17:00-17:20 (20min) Diner de gala 18:30 - 23:55 (5h25) Diner de gala Attention, si vous arrivez trop tard, le bateau partira sans vous.	Conférence plénière de Romain Lesur 9:00 - 9:40 (40min) Conférence plénière de Romain Lesur A250 David Gohel Shiny 9:40 - 10:40 (1h) Shiny A250 Swann Floc'hlay › Microstructure Information from Diffusion Imaging - Aymeric Stamm, Department of Mathematics Jean Leray 09:40-10:00 (20min) › Esquisse, un outil de visualisation - Victor PERRIER, dreamRs 10:00-10:20 (20min) › webR, et le futur des apps web avec R - Colin FAY, ThinkR 10:20-10:40 (20min) Pause café 10:40 - 11:10 (30min) Pause café Hall principal Conférence plénière de Philippe Grosjean 11:10 - 11:50 (40min) Conférence plénière de Philippe Grosjean A250 Chloé Friguet › Apprendre R et les statistiques... grâce à R - Philippe Grosjean, Université de Mons - UMONS (BELGIQUE) 11:10-11:50 (40min) Discours de clôture 11:50 - 12:00 (10min) Discours de clôture A250 Chloé Friguet, présidente du comité d'organisation des rencontres R Déjeuner 12:00 - 14:00 (2h) Déjeuner Hall principal