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9:00 - 10:00 (1h)
Accueil des participants et pause café
Hall principal
10:00 - 12:00 (2h)
Tutoriel "Dérivation automatique et optimisation avec la libraire Torch"
S211
› Dérivation automatique et optimisation avec la libraire torch
- Tristan Mary-Huard, Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale)
10:00-12:00 (2h)
10:00 - 12:00 (2h)
Tutoriel "Créez des environements reproductibles avec rix"
A101
Bruno André Rodrigues Coelho
› Créez des environements reproductibles avec rix
- Bruno André Rodrigues Coelho, Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche
10:00-12:00 (2h)
12:00 - 14:00 (2h)
Déjeuner
Hall principal
14:00 - 14:10 (10min)
Ouverture des rencontres R 2024
A500
Chloé Friguet présidente du comité d'organisation des rencontres
14:10 - 14:50 (40min)
Conférence plénière de Cécile Proust-Lima
A500
Solène Desmée
› Modélisation conjointe de données longitudinales et de temps d'événements sous R
- Cécile Proust-Lima, Bordeaux population health
14:10-14:50 (40min)
15:00 - 16:00 (1h)
Biostatistique
A500
Julie Aubert
› Extending code from the saemix package to fit parametric joint models in R
- Emmanuelle Comets, Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution, Institut de recherche en santé, environnement et travail
15:00-15:20 (20min)
› Mise en oeuvre de méthodes semi-Bayésiennes de calcul des erreurs standards pour les données éparses dans le package saemix
- Mélanie Guhl, Université Paris Cité, INSERM, IAME, UMR 1137
15:20-15:40 (20min)
› BeQut, un package R pour l'estimation bayésienne de modèles de régression quantile à effets mixtes via JAGS
- Antoine Barbieri, Univ. Bordeaux, Inserm BPH U1219, F-33000, Bordeaux
15:40-16:00 (20min)
16:00 - 16:30 (30min)
Pause café
Hall principal
16:30 - 17:10 (40min)
Reproductibilité
A500
Aurélie Siberchicot
› Garantir des analyses fiables avec les packages R : perspectives de la recherche clinique
- Yann Féat, mainanalytics GmbH
16:30-16:50 (20min)
› Créez des environements reproductibles avec rix
- Bruno André Rodrigues Coelho, Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche
16:50-17:10 (20min)
17:20 - 17:50 (30min)
Courte 1
A500
Vincent Brault
› Une enquête auprès des métiers de la « data » : quelle place pour R et ses utilisateurs ?
- Antoine GIRARD, data analyst indépendant
17:24-17:30 (06min)
› ProteoBayes : un cadre bayésien pour l'analyse protéomique différentielle
- Marie Chion, MRC Biostatistics Unit, University of Cambridge
17:32-17:38 (06min)
› Comment les communautés autour de R peuvent changer vos pRojets
- Marie Vaugoyeau, MStats
17:44-17:50 (06min)
18:00 - 20:00 (2h)
Poster et cocktail dinatoire
Hall principal
› hubeau: un package pour interroger les APIs du Système d'Information sur l'eau en France
- Pascal Irz, Direction régionale Bretagne
18:00-20:00 (2h)
› SK8 : Un service institutionnel de gestion et d'hébergement d'applications Shiny
- jean-françois rey, Biostatistique et Processus Spatiaux - Élise Maigné, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse
18:00-20:00 (2h)
› Créer un site pour partager sa recherche avec R, blogdown et Hugo
- Fanny Ollivier, Laboratoire de Psychologie des Pays de la Loire
18:00-20:00 (2h)
› Les packages autour de JDemetra+ (rjd3) : une boîte à outils complète pour l'analyse des séries temporelles
- Tanguy BARTHELEMY, INSEE
18:00-20:00 (2h)
› Poster autour du package {datamods}
- Samra Goumri, dreamRs - Victor PERRIER, dreamRs
18:00-20:00 (2h)
› Distance/Divergence entre distributions t multivariées
- Pierre Santagostini, IRHS - Équipe ImHorPhen (Imagerie pour l'Horticulture et le Phénotypage)
18:00-20:00 (2h)
› A survey translation tool to easily migrate from Qualtrics to LimeSurvey
- Camille Straboni, Département d'Etudes Cognitives - ENS Paris
18:00-20:00 (2h)
› RecForest : Forêts aléatoires de survie pour l'analyse des événements récurrents en R
- Juliette Murris, Health data- and model- driven Knowledge Acquisition
18:00-20:00 (2h)
› Des tableaux et des graphiques prêts à publication avec les packages R {tabularise} et {chart} de la suite SciViews
- Guyliann Engels, Service d'écologie numérique, Institut Complexys & Infortech, Université de Mons, Cellule de Pédagogie Facultaire des Sciences, Université de Mons
18:00-20:00 (2h)
9:00 - 9:40 (40min)
Conférence plénière de Nicolas Raillard
A250
Audrey Poterie
9:40 - 10:20 (40min)
Dataviz
A250
Julie Lenoir
› telraamStats : visualisation des mobilités pour la recherche et les citoyen·ne·s
- Ketsia Guichard-Sustowski, Institut de Recherche Mathématique de Rennes, Centre de recherche en économie et management
09:40-10:00 (20min)
› Collecter et cartographier les données du bilan carbone d'un congrès
- Chloé Friguet, Université Bretagne Sud / IRISA et François Husson, Laboratoire de Mathématiques Appliquées - Agrocampus Rennes
10:00-10:20 (20min)
10:20 - 10:50 (30min)
Pause café
Hall principal
10:50 - 12:10 (1h20)
Méthode statistique
A250
Vincent Brault
› Estimation de quantiles conditionnels extrêmes : Package Extremefit
- Gilles Durrieu, Laboratoire de Mathématiques de Bretagne Atlantique
10:50-11:10 (20min)
› Clustering sur données incomplètes avec clusterMI
- Vincent Audigier, Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] : EA4629
11:10-11:30 (20min)
› Créer son propre package d'extension {recipes}: retour d'expérience de {scimo}
- Antoine Bichat, Les Laboratoires Servier
11:30-11:50 (20min)
› Smooth testing and clustering of copulas
- Yves Ismaël NGOUNOU BAKAM, CREST-ENSAI
11:50-12:10 (20min)
12:10 - 13:30 (1h20)
Déjeuner
Hall principal
13:30 - 14:10 (40min)
Conférence plénière d'Elise Maigné
A250
Paul Bastide
› SK8 : Pour des applications shiny qui se déploient comment sur des roulettes
- Elise Maigné, MIA-T
13:30-14:10 (40min)
14:10 - 14:40 (30min)
Courte 2
A250
François Husson
› Explorer et comparer des cartes de zones climatiques locales avec le paquet lczexplore
- Matthieu Gousseff, Equipe DECIDE
14:10-14:16 (06min)
› Des applications Shiny qui facilitent la vie
- Terence Dechaux, Institut de l'élevage
14:16-14:22 (06min)
› Application Shiny XPBlocs - Création de blocs en expérimentation
- Maxime Legris, Institut de l'Elevage
14:22-14:28 (06min)
› Utilisation du package {flexdashboard} pour le contrôle des données de biologie dans un entrepôt de données de santé
- Morgane Pierre-Jean, Univ Rennes, CHU Rennes, INSERM, LTSI-UM R 1099
14:28-14:34 (06min)
› easy16S : une application Shiny pour explorer ses données métagénomiques
- Cédric Midoux, Université Paris-Saclay, INRAE, PROSE, 92160, Antony, France, Université Paris-Saclay, INRAE, MaIAGE, 78350, Jouy-en-Josas, France, Université Paris-Saclay, INRAE, BioinfOmics, MIGALE bioinformatics facility, 78350, Jouy-en-Josas, France
14:34-14:40 (06min)
14:50 - 15:50 (1h)
Statistique pour l'environnement
A250
Baptiste Alglave
› Human in the deep: Converting research activities pressures into ecological impact assessment.
- Riwan Leroux, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer
14:50-15:10 (20min)
› Maturation de codes scientifiques R de traitement de données liées à l'Eau au BRGM (initiative MATUREAU)
- Marc Laurencelle, Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM)
15:10-15:30 (20min)
› Un suivi régionalisé et actualisé des étiages des petits cours d'eau, c'est possible avec R, Hub'Eau et GitHub !
- Pascal Irz, Direction régionale Bretagne
15:30-15:50 (20min)
15:50 - 16:20 (30min)
Pause café
Hall principal
16:20 - 17:20 (1h)
Gestion de projet R, bonnes pratiques
A250
Pierre Gloaguen
› Sécurisation des analyses statistiques avec R : retour d'expérience
- Aurore Philibert, Pôle Biostatistique - Julien Dugas, Pôle Biostatistique
16:20-16:40 (20min)
› Refactoring : du code qui marche, c'est bien, mais du code maintenable, c'est mieux
- Vincent Guyader, ThinkR
16:40-17:00 (20min)
› Une vie polyamoureuse entre R et Julia
- Remy Drouilhet, Laboratoire Jean Kuntzmann
17:00-17:20 (20min)
16:20 - 17:20 (1h)
Aide à la vie de tous les jours et à l'enseignement
A101
Audrey Lavenu
› Un petit coup de polish - Nettoyage de fichiers Excel avec R
- Thomas Vroylandt, Kantiles
16:20-16:40 (20min)
› {saperlipopette}, un paquet R pour progresser en Git en toute sérénité
- Maëlle SALMON, rOpenSci, cynkra
16:40-17:00 (20min)
› Génération aléatoire d'exercices de biostatistiques pour Moodle via le package SARP.Moodle de R
- Emmanuel Curis, UR 7537 BioSTM, Faculté de pharmacie de Paris, Service d'Hématologie Biologique [CHU Lariboisière]
17:00-17:20 (20min)
18:30 - 23:55 (5h25)
Diner de gala
Attention, si vous arrivez trop tard, le bateau partira sans vous.
9:00 - 9:40 (40min)
Conférence plénière de Romain Lesur
A250
David Gohel
9:40 - 10:40 (1h)
Shiny
A250
Swann Floc'hlay
› Microstructure Information from Diffusion Imaging
- Aymeric Stamm, Department of Mathematics Jean Leray
09:40-10:00 (20min)
10:40 - 11:10 (30min)
Pause café
Hall principal
11:10 - 11:50 (40min)
Conférence plénière de Philippe Grosjean
A250
Chloé Friguet
› Apprendre R et les statistiques... grâce à R
- Philippe Grosjean, Université de Mons - UMONS (BELGIQUE)
11:10-11:50 (40min)
11:50 - 12:00 (10min)
Discours de clôture
A250
Chloé Friguet, présidente du comité d'organisation des rencontres R
12:00 - 14:00 (2h)
Déjeuner
Hall principal
